如果冷凝器不清洗，会造成冷凝器风扇不能带走多余热量，制冷设备制冷量会减少。比如空调不制冷，制冰机产量不足等。所以要定期清洗冷凝器，方法如下：
1、风冷式冷凝器是以空气作为冷却介质的，由于空气中常有灰尘，部分灰尘会粘结在冷凝器翅片的外表面上，时间久了，会使冷凝器的散热效果变差，特别是
环境比较恶劣的地方，因此应该定期进行冷凝器翅片清洗。清洗的方法是：单纯的灰尘可以用压缩机空气等吹干净，如果污物较多，应采用无腐蚀作用的清洗
剂清洗散热管和翅片，达到改善散热效果的目的。
2、对于水冷式冷凝器，因冷却水大多数含有钙、镁离子和酸式碳酸盐。当冷却水流经金属表面时，有碳酸盐的生成。另外，溶解在冷却水中的氧还会造成金属
腐蚀，形成铁锈。由于锈垢的产生，换热效果下降。严重时不得不在壳体外喷淋冷却水，结垢严重时会堵塞管子，使换热效果失去作用。
研究的数据显示水垢沉积物对热传输的损失影响巨大，随着沉积物的增加会造成能源费用的加大。即使很薄的一层水垢就要增加设备中结垢部分40%以上的运行
费用。保持冷却通道中不含矿物沉积物可以很好的提高、节约能源、延长设备的使用寿命，同时节约生产时间和费用。
主要是清除水垢的问题。清洗时间根据水质不同，水质差的至少每年清洗一次;水质比降好的地方，可2~3年清洗一次。
水冷式冷水机配用壳管式水冷冷凝器，可采用酸洗。具体的清洗方法主要分三种：
1） 循环清洗：在线针对换热设备进行循环清洗；普通设备3-5小时完成，大系统不超过12小时。
2） 浸泡清洗：对于一些体积较小的冷凝器、可采用浸泡的方法4-6个小时。
3） 喷淋清洗：对于表层大面积结垢的板式设备 ，可以用喷淋的方法清洗。